Pôle de Paléogénomique et Taphonomie Moléculaire (PPTM)
Directrice scientifique et technique :
Eva-Maria Geigl (Equipe Epigénome et Paléogénome)
Tel. 01 57 27 81 32
6ème étage, pièces 654B-656B et 5ème étage, pièces 583B-585B
Le Centre de paléogénomique et de taphonomie moléculaire est un laboratoire à haut niveau de confinement permettant l’analyse d’ADN ancien et hautement dégradé. Il fait partie de l’Institut Jacques Monod.
Le Centre comprend une infrastructure spécifique dédiée à la paléogénomique et est située au 6ème étage de l’institut de laboratoires de biologie moléculaire. Ce laboratoire est confiné avec un sas et une pression d’air positive intégrée dans la circulation d’air de l’institut empêchant l’ADN environnemental de pénétrer dans le laboratoire.
Les laboratoires de biologie moléculaire de l’équipe « Epigénomique et Paléogénomique » sont situés au 5ème étage de l’Institut et sont rattachés au PPTM. Une installation génomique au 5ème étage est également accessible.
Le PPTM est principalement utilisé par l’équipe « Epigénomique et Paléogénomique » mais est également ouvert à d’autres groupes de recherche nationaux et internationaux dans le cadre de projets de recherche interdisciplinaires en collaboration avec l’équipe.
Thèmes de recherche
- Développement méthodologique en paléogénomique
- Évolution humaine et peuplement de l’Europe
- Phylogénie, phylogéographie des populations animales
- Domestication des animaux
- Analyse de la dégradation et de la conservation de l’ADN au cours du temps
Mots-clés : paléogénomique, évolution, ADN ancien, phylogénie, peuplement, domestication
Expertise
L’équipe « Epigénomique et Paléogénomique » est experte en paléogénomique, c’est-à-dire dans l’extraction et la purification d’ADN à partir de matériel ancien, la construction de banques d’ADN, leur séquençage, et l’analyse bioinformatique et statistique des séquences d’ADN. L’ADN ancien étant très dégradé, toutes ces étapes d’analyse requièrent une expertise spécifique et rare.
Equipement
- Postes de travail expérimentaux
- Hotte à flux laminaire
- Hotte de filtration
- cryobroyeur (6775 Freezer/Mill®Spex SamplePrep)
- Scies Dremel
- 2 Balances
- 2 centrifugeuses de paillasse
- 1 centrifugeuse réfrigérante
- 1 Système d’irradiation UV dédié à la liaison d’acides nucléiques
- Lampes UV
- Appareils Biozone (appareils de décontamination produisant de l’ozone)
- Multipipettes électroniques Integra
Les différents postes de travail, les hottes de flux laminaire et de filtration sont tous équipés de lampes UV germicides et d’un dispositif Biozone. Le laboratoire est aménagé de manière à permettre une séparation physique maximale entre les différentes étapes expérimentales afin de minimiser le transfert de molécules d’ADN.